آبی که سالم و گوارا است بو و طعم بدی را نمی دهد. بو و طعم بد در آب خبر از فساد و عوامل میکروبی را دارد. باید خیلی این موضوع را جدی گرفت. به علت اینکه کلر موجود در آب از فیلتر مرحله دوم حذف می شود، در صورت آلودگی خیلی کم هم امکان رشد آلودگی در آب ایجاد می شود. موارد زیر در ایجاد بوی بد در آب موثر هستند.